Основными задачами научно-исследовательской деятельности МУМЦФМ являются:
- приоритетное развитие фундаментальных знаний посредством организации и проведения научно-исследовательских работ и аналитических исследований в целях повышения рейтинга соответствия Российской Федерации и государств-партнеров международным стандартам в сфере противодействия легализации (отмыванию) доходов, полученных преступным путем, и финансированию терроризма (ПОД/ФТ);
- формирование научной базы и единого научного пространства для национальных антиотмывочных систем государств-участников Содружества независимых государств (СНГ) и Евразийской группы по противодействию легализации преступных доходов и финансированию терроризма (ЕАГ);
- разработка и актуализация научно-методических и учебно-методических материалов для формирования образовательных программ и реализации мероприятий в рамках дополнительного профессионального образования, а также учебных курсов, семинаров, круглых столов, конференций и др.